Interaction between environmental and socioeconomic determinants for cutaneous leishmaniasis risk in Latin America.

OBJECTIVE: Determine and characterize potential risk areas for the occurrence of cutaneous leishmaniasis (CL) in Latin America (LA). METHOD: Ecological observational study with observation units defined by municipalities with CL transmission between 2014-2018. Environmental and socioeconomic variables available for at least 85% of the municipalities were used, combined in a single database, utilizing the R software. The principal component analysis methodology was combined with a hierarchical cluster analysis to group clusters of municipalities based on their similarity. The V-test was estimated to define the positive or negative association of the variables with the clusters and separation by natural breaks was used to determine which ones contributed the most to each cluster. Information on cases was also incorporated in the analyses to attribute CL risk for each cluster. RESULTS: This study included 4,951 municipalities with CL transmission (36.5% of the total in LA) and seven clusters were defined by their association with 18 environmental and socioeconomic variables. The historical risk of CL is positively associated with the Amazonian, Andean and Savannah clusters in a decreasingly manner; and negatively associated with the Forest evergreen, Forest/crop and Forest/populated clusters. The Agricultural cluster did not reveal any association with the CL cases. CONCLUSIONS: The study made it possible to identify and characterize the CL risk by clusters of municipalities and to recognize the epidemiological distribution pattern of transmission, which provides managers with better information for intersectoral interventions to control CL.

Interaction between environmental and socioeconomic determinants for cutaneous leishmaniasis risk in Latin America

[ABSTRACT]. Objective. Determine and characterize potential risk areas for the occurrence of cutaneous leishmaniasis (CL) in Latin America (LA).Method. Ecological observational study with observation units defined by municipalities with CL transmission between 2014-2018. Environmental and socioeconomic variables available for at least 85% of the municipal-ities were used, combined in a single database, utilizing the R software. The principal component analysis methodology was combined with a hierarchical cluster analysis to group clusters of municipalities based on their similarity. The V-test was estimated to define the positive or negative association of the variables with the clusters and separation by natural breaks was used to determine which ones contributed the most to each cluster. Information on cases was also incorporated in the analyses to attribute CL risk for each cluster.Results. This study included 4,951 municipalities with CL transmission (36.5% of the total in LA) and seven clusters were defined by their association with 18 environmental and socioeconomic variables. The histori-cal risk of CL is positively associated with the Amazonian, Andean and Savannah clusters in a decreasingly manner; and negatively associated with the Forest evergreen, Forest/crop and Forest/populated clusters. The Agricultural cluster did not reveal any association with the CL cases.Conclusions. The study made it possible to identify and characterize the CL risk by clusters of municipalities and to recognize the epidemiological distribution pattern of transmission, which provides managers with better information for intersectoral interventions to control CL.

[RESUMEN]. Objetivo. Determinar y caracterizar áreas de riesgo potencial de la ocurrencia de leishmaniasis cutánea (LC) en América Latina (AL).Método. Estudio observacional ecológico con unidades de observación definidas por municipios con transmisión de LC entre 2014-2018. Se utilizaron variables medioambientales y socioeconómicas disponibles para al menos 85% de los municipios, combinados en una sola base de datos, a través del software R. Se combinó la metodología de análisis de componentes principales con un análisis de conglomerados jerárquicos para la formación de conglomerados de municipios en función de su similitud. Se estimó el V-test para definir la asociación positiva o negativa de las variables con los conglomerados y separación por divisiones naturales para determinar cuáles contribuyeron más a cada conglomerado. Se incorporaron los casos para atribuir el riesgo de LC para cada conglomerado.Resultados. Se incluyeron en el estudio 4 951 municipios con transmisión de LC (36,5% del total en AL) y se definieron siete conglomerados por su asociación con 18 variables medioambientales y socioeconómicas. El riesgo histórico de LC se asocia de manera positiva y en forma decreciente con los conglomerados Amazónico, Andino y Sabana; y de manera negativa con los conglomerados Boscoso/perenne, Boscoso/cultivo y Boscoso/poblado. El conglomerado Agrícola no reveló ninguna asociación con los casos de LC.Conclusiones. El estudio permitió identificar y caracterizar el riesgo de LC por conglomerados de municipios y conocer el patrón propio epidemiológico de distribución de la transmisión, lo que proporciona a los gestores una mejor información para las intervenciones intersectoriales para el control de la LC.

[RESUMO]. Objetivo. Determinar e caracterizar as áreas de risco de ocorrência de leishmaniose cutânea na América Latina.Método. Estudo observacional ecológico com unidades de observação definidas por municípios com transmissão de leishmaniose cutânea entre 2014 e 2018. Foram usadas as variáveis ambientais e socioeconômicas disponíveis em 85% ou mais dos municípios, reunidas em uma única base de dados com o uso do software R. A metodologia de análise de componentes principais foi combinada a uma análise de conglomerados com agrupamento hierárquico para formar conglomerados de municípios por semelhança. O teste V foi usado para estabelecer a associação (positiva ou negativa) das variáveis com os conglomerados e uma separação por divisões naturais foi usada para determinar as variáveis que mais contribuíram em cada conglomerado. Os casos foram incluídos para avaliar o risco de leishmaniose cutânea em cada conglomerado.Resultados. A amostra do estudo compreendeu 4.951 municípios com transmissão de leishmaniose cutânea (36,5% do total na América Latina). Foram definidos sete conglomerados por apresentarem associação com 18 variáveis ambientais e socioeconômicas. Foi observada associação positiva e decrescente do risco histórico de leishmaniose cutânea com os conglomerados Amazônico, Andino e Savana e negativa com os conglomerados Mata/perene, Mata/cultivo e Mata/povoado. O conglomerado Agrícola não demonstrou asso-ciação com casos de leishmaniose cutânea.Conclusões. Este estudo permitiu identificar e caracterizar o risco de leishmaniose cutânea por conglomerados de municípios e conhecer o padrão epidemiológico de distribuição da transmissão da doença, oferecendo às autoridades dados melhores para subsidiar as intervenções intersetoriais para o controle da leishmaniose cutânea.

[Interaction among environmental and socioeconomic determinants of risk for cutaneous leishmaniasis in Latin AmericaInteração entre os determinantes ambientais e socioeconômicos para o risco de leishmaniose cutânea na América Latina]. / Interacción entre los determinantes medioambientales y socioeconómicos para el riesgo para leishmaniasis cutánea en América Latina.

OBJECTIVE: Determine and characterize areas at potential risk for the occurrence of cutaneous leishmaniasis (CL) in Latin America. METHOD: Ecological observational study with observation units defined by municipalities with CL transmission during 2014-2018. Environmental and socioeconomic variables available for at least 85% of municipalities were combined in a single database, using R software. Principal component analysis was combined with hierarchical cluster analysis for the formation of clusters of municipalities according to their similarity. The V-test was used to define positive or negative association of variables with clusters and separation by natural divisions to determine which contributed more to each cluster. Cases were included to attribute CL risk for each cluster. RESULTS: The study included 4 951 municipalities with CL transmission (36.5% of municipalities in Latin America); seven clusters were defined by their association with 18 environmental and socioeconomic variables. Historical risk of CL is associated positively and in descending order with the Amazonian, Andean, and Savanna clusters; and negatively with the Forest/perennial, Forest/cultivated, and Forest/populated clusters. The Agricultural cluster showed no association with CL cases. CONCLUSIONS: The study made it possible to identify and characterize CL risk by clusters of municipalities and to understand the characteristic epidemiological distribution patterns of transmission, providing program managers with better information for intersectoral interventions to control CL.

OBJETIVO: Determinar e caracterizar as áreas de risco de ocorrência de leishmaniose cutânea na América Latina. MÉTODO: Estudo observacional ecológico com unidades de observação definidas por municípios com transmissão de leishmaniose cutânea entre 2014 e 2018. Foram usadas as variáveis ambientais e socioeconômicas disponíveis em 85% ou mais dos municípios, reunidas em uma única base de dados com o uso do software R. A metodologia de análise de componentes principais foi combinada a uma análise de conglomerados com agrupamento hierárquico para formar conglomerados de municípios por semelhança. O teste V foi usado para estabelecer a associação (positiva ou negativa) das variáveis com os conglomerados e uma separação por divisões naturais foi usada para determinar as variáveis que mais contribuíram em cada conglomerado. Os casos foram incluídos para avaliar o risco de leishmaniose cutânea em cada conglomerado. RESULTADOS: A amostra do estudo compreendeu 4.951 municípios com transmissão de leishmaniose cutânea (36,5% do total na América Latina). Foram definidos sete conglomerados por apresentarem associação com 18 variáveis ambientais e socioeconômicas. Foi observada associação positiva e decrescente do risco histórico de leishmaniose cutânea com os conglomerados Amazônico, Andino e Savana e negativa com os conglomerados Mata/perene, Mata/cultivo e Mata/povoado. O conglomerado Agrícola não demonstrou associação com casos de leishmaniose cutânea. CONCLUSÕES: Este estudo permitiu identificar e caracterizar o risco de leishmaniose cutânea por conglomerados de municípios e conhecer o padrão epidemiológico de distribuição da transmissão da doença, oferecendo às autoridades dados melhores para subsidiar as intervenções intersetoriais para o controle da leishmaniose cutânea.

Interacción entre los determinantes medioambientales y socioeconómicos para el riesgo de leishmaniasis cutánea en América Latina

[RESUMEN]. Objetivo. Determinar y caracterizar áreas de riesgo potencial de la ocurrencia de leishmaniasis cutánea (LC) en América Latina (AL). Método. Estudio observacional ecológico con unidades de observación definidas por municipios con transmisión de LC entre 2014-2018. Se utilizaron variables medioambientales y socioeconómicas disponibles para al menos 85% de los municipios, combinados en una sola base de datos, a través del software R. Se combinó la metodología de análisis de componentes principales con un análisis de conglomerados jerárquicos para la formación de conglomerados de municipios en función de su similitud. Se estimó el V-test para definir la asociación positiva o negativa de las variables con los conglomerados y separación por divisiones naturales para determinar cuáles contribuyeron más a cada conglomerado. Se incorporaron los casos para atribuir el riesgo de LC para cada conglomerado. Resultados. Se incluyeron en el estudio 4 951 municipios con transmisión de LC (36,5% del total en AL) y se definieron siete conglomerados por su asociación con 18 variables medioambientales y socioeconómicas. El riesgo histórico de LC se asocia de manera positiva y en forma decreciente con los conglomerados Amazónico, Andino y Sabana; y de manera negativa con los conglomerados Boscoso/perenne, Boscoso/cultivo y Boscoso/poblado. El conglomerado Agrícola no reveló ninguna asociación con los casos de LC. Conclusiones. El estudio permitió identificar y caracterizar el riesgo de LC por conglomerados de municipios y conocer el patrón propio epidemiológico de distribución de la transmisión, lo que proporciona a los gestores una mejor información para las intervenciones intersectoriales para el control de la LC.

[ABSTRACT]. Objective. Determine and characterize areas at potential risk for the occurrence of cutaneous leishmaniasis (CL) in Latin America. Method. Ecological observational study with observation units defined by municipalities with CL transmission during 2014-2018. Environmental and socioeconomic variables available for at least 85% of municipalities were combined in a single database, using R software. Principal component analysis was combined with hierarchical cluster analysis for the formation of clusters of municipalities according to their similarity. The V-test was used to define positive or negative association of variables with clusters and separation by natural divisions to determine which contributed more to each cluster. Cases were included to attribute CL risk for each cluster. Results. The study included 4 951 municipalities with CL transmission (36.5% of municipalities in Latin America); seven clusters were defined by their association with 18 environmental and socioeconomic variables. Historical risk of CL is associated positively and in descending order with the Amazonian, Andean, and Savanna clusters; and negatively with the Forest/perennial, Forest/cultivated, and Forest/populated clusters. The Agricultural cluster showed no association with CL cases. Conclusions. The study made it possible to identify and characterize CL risk by clusters of municipalities and to understand the characteristic epidemiological distribution patterns of transmission, providing program managers with better information for intersectoral interventions to control CL.

[RESUMO]. Objetivo. Determinar e caracterizar as áreas de risco de ocorrência de leishmaniose cutânea na América Latina. Método. Estudo observacional ecológico com unidades de observação definidas por municípios com transmissão de leishmaniose cutânea entre 2014 e 2018. Foram usadas as variáveis ambientais e socioeconômicas disponíveis em 85% ou mais dos municípios, reunidas em uma única base de dados com o uso do software R. A metodologia de análise de componentes principais foi combinada a uma análise de conglomerados com agrupamento hierárquico para formar conglomerados de municípios por semelhança. O teste V foi usado para estabelecer a associação (positiva ou negativa) das variáveis com os conglomerados e uma separação por divisões naturais foi usada para determinar as variáveis que mais contribuíram em cada conglomerado. Os casos foram incluídos para avaliar o risco de leishmaniose cutânea em cada conglomerado. Resultados. A amostra do estudo compreendeu 4.951 municípios com transmissão de leishmaniose cutânea (36,5% do total na América Latina). Foram definidos sete conglomerados por apresentarem associação com 18 variáveis ambientais e socioeconômicas. Foi observada associação positiva e decrescente do risco histórico de leishmaniose cutânea com os conglomerados Amazônico, Andino e Savana e negativa com os conglomerados Mata/perene, Mata/cultivo e Mata/povoado. O conglomerado Agrícola não demonstrou associação com casos de leishmaniose cutânea. Conclusões. Este estudo permitiu identificar e caracterizar o risco de leishmaniose cutânea por conglomerados de municípios e conhecer o padrão epidemiológico de distribuição da transmissão da doença, oferecendo às autoridades dados melhores para subsidiar as intervenções intersetoriais para o controle da leishmaniose cutânea.

Interacción entre los determinantes medioambientales y socioeconómicos para el riesgo para leishmaniasis cutánea en América Latina / Interaction among environmental and socioeconomic determinants of risk for cutaneous leishmaniasis in Latin America / Interação entre os determinantes ambientais e socioeconômicos para o risco de leishmaniose cutânea na América Latina

RESUMEN Objetivo. Determinar y caracterizar áreas de riesgo potencial de la ocurrencia de leishmaniasis cutánea (LC) en América Latina (AL). Método. Estudio observacional ecológico con unidades de observación definidas por municipios con transmisión de LC entre 2014-2018. Se utilizaron variables medioambientales y socioeconómicas disponibles para al menos 85% de los municipios, combinados en una sola base de datos, a través del software R. Se combinó la metodología de análisis de componentes principales con un análisis de conglomerados jerárquicos para la formación de conglomerados de municipios en función de su similitud. Se estimó el V-test para definir la asociación positiva o negativa de las variables con los conglomerados y separación por divisiones naturales para determinar cuáles contribuyeron más a cada conglomerado. Se incorporaron los casos para atribuir el riesgo de LC para cada conglomerado. Resultados. Se incluyeron en el estudio 4 951 municipios con transmisión de LC (36,5% del total en AL) y se definieron siete conglomerados por su asociación con 18 variables medioambientales y socioeconómicas. El riesgo histórico de LC se asocia de manera positiva y en forma decreciente con los conglomerados Amazónico, Andino y Sabana; y de manera negativa con los conglomerados Boscoso/perenne, Boscoso/cultivo y Boscoso/poblado. El conglomerado Agrícola no reveló ninguna asociación con los casos de LC. Conclusiones. El estudio permitió identificar y caracterizar el riesgo de LC por conglomerados de municipios y conocer el patrón propio epidemiológico de distribución de la transmisión, lo que proporciona a los gestores una mejor información para las intervenciones intersectoriales para el control de la LC.

ABSTRACT Objective. Determine and characterize areas at potential risk for the occurrence of cutaneous leishmaniasis (CL) in Latin America. Method. Ecological observational study with observation units defined by municipalities with CL transmission during 2014-2018. Environmental and socioeconomic variables available for at least 85% of municipalities were combined in a single database, using R software. Principal component analysis was combined with hierarchical cluster analysis for the formation of clusters of municipalities according to their similarity. The V-test was used to define positive or negative association of variables with clusters and separation by natural divisions to determine which contributed more to each cluster. Cases were included to attribute CL risk for each cluster. Results. The study included 4 951 municipalities with CL transmission (36.5% of municipalities in Latin America); seven clusters were defined by their association with 18 environmental and socioeconomic variables. Historical risk of CL is associated positively and in descending order with the Amazonian, Andean, and Savanna clusters; and negatively with the Forest/perennial, Forest/cultivated, and Forest/populated clusters. The Agricultural cluster showed no association with CL cases. Conclusions. The study made it possible to identify and characterize CL risk by clusters of municipalities and to understand the characteristic epidemiological distribution patterns of transmission, providing program managers with better information for intersectoral interventions to control CL.

RESUMO Objetivo. Determinar e caracterizar as áreas de risco de ocorrência de leishmaniose cutânea na América Latina. Método. Estudo observacional ecológico com unidades de observação definidas por municípios com transmissão de leishmaniose cutânea entre 2014 e 2018. Foram usadas as variáveis ambientais e socioeconômicas disponíveis em 85% ou mais dos municípios, reunidas em uma única base de dados com o uso do software R. A metodologia de análise de componentes principais foi combinada a uma análise de conglomerados com agrupamento hierárquico para formar conglomerados de municípios por semelhança. O teste V foi usado para estabelecer a associação (positiva ou negativa) das variáveis com os conglomerados e uma separação por divisões naturais foi usada para determinar as variáveis que mais contribuíram em cada conglomerado. Os casos foram incluídos para avaliar o risco de leishmaniose cutânea em cada conglomerado. Resultados. A amostra do estudo compreendeu 4.951 municípios com transmissão de leishmaniose cutânea (36,5% do total na América Latina). Foram definidos sete conglomerados por apresentarem associação com 18 variáveis ambientais e socioeconômicas. Foi observada associação positiva e decrescente do risco histórico de leishmaniose cutânea com os conglomerados Amazônico, Andino e Savana e negativa com os conglomerados Mata/perene, Mata/cultivo e Mata/povoado. O conglomerado Agrícola não demonstrou associação com casos de leishmaniose cutânea. Conclusões. Este estudo permitiu identificar e caracterizar o risco de leishmaniose cutânea por conglomerados de municípios e conhecer o padrão epidemiológico de distribuição da transmissão da doença, oferecendo às autoridades dados melhores para subsidiar as intervenções intersetoriais para o controle da leishmaniose cutânea.

Análisis de datos basados en evidencia para la caracterización epidemiológica de leishmaniasis en Paraguay: I - Leishmaniasis tegumentaria

Resumen La leishmaniasis es una enfermedad desatendida, transmitida por dípteros de los géneros Phlebotomus y Lutzomyia. Existen tres formas clínicas principales de leishmaniasis: una visceral, y dos tegumentarias, las cuales se dividen en leishmaniasis cutánea (LC) y leishmaniasis mucocutánea (LM), todas presentes en Paraguay. El objetivo de este trabajo es describir las características epidemiológicas de la leishmaniasis tegumentaria en Paraguay. Aquí analizamos datos epidemiológicos de leishmaniasis tegumentaria (incluyendo LC y ML), tomados desde el 2006 hasta el 2017. La identidad de los pacientes se mantuvo confidencial. Un total de 2.918 casos positivos de leishmaniasis fueron estudiados. El pico de casos reportados se dio en el 2007. Una vista general muestra una disminución en la tendencia de leishmaniasis tegumentaria, donde los varones son más afectados que las mujeres, y el área endémica está localizada en las zonas este y noreste de Paraguay. Los casos en el Chaco (al oeste del Río Paraguay) están en aumento. La incidencia de leishmaniasis tegumentaria para el país es de 4 personas por 100.000 habitantes. Esta es considerada una enfermedad ocupacional ya que el 67% de los pacientes infectados fueron trabajadores rurales. Durante el periodo de estudio, la LC fue más común que la LM, excepto en los años 2010, 2014 y 2017. La mayoría de los pacientes afectados por LM son de avanzada edad. Conclusión. Remarcamos que la leishmaniasis no está restringida a las áreas húmedas del este de Paraguay, debido a que está también presente en zonas xerofíticas de Paraguay y Bolivia. Los trabajadores rurales de sexo masculino comprenden el grupo más susceptible. La alta frecuencia de LM en algunos años indica que es necesario que las agencias nacionales lleven a cabo más programas de educación en salud para prevenir o reducir la carga de LC (y por consiguiente también de LM) en el país.

Abstract Leishmaniasis is a neglected disease transmitted by sandflies of the genera Phlebotomus and Lutzomyia. There are three main clinical forms of leishmaniasis: one visceral and two tegumentary, differentiated between cutaneous leishmaniasis (CL) and mucocutaneous leishmaniasis (ML), all present in Paraguay. The objective of this work is to describe the epidemiologic characteristics of tegumentary leishmaniasis in Paraguay. Here we analyzed epidemiological data of tegumentary leishmaniasis (including CL and ML), taken from 2006 to 2017. Patients' identities were kept confidential. A total of 2,918 cases of positive leishmaniasis infection were studied. The peak of reported cases was in 2007. An overview shows a decrease in the trend of tegumentary leishmaniasis, where males are more affected than females, and the endemic area located on the east and north-eastern parts of Paraguay. Cases in the Chaco (west of Paraguay river) are increasing. The incidence of tegumentary leishmaniasis for the country is 4 persons per 100,000 inhabitants. This is considered an occupational disease since 67% of the infected patients were rural workers. During the period of study CL was more common than ML, except for the years 2010, 2014, and 2017. Most of the patients affected by ML are elders. Conclusion. We remark that leishmaniasis is not only restricted to the humid area of eastern Paraguay, since it is also present in xerophytic areas of Paraguay and Bolivia. Male rural workers are the most susceptible group. The high frequency of ML in some years indicates that more educational programs have to be carried out by national agencies to prevent and reduce the burden of CL (and thus also ML) in the country.

Premature deaths by visceral leishmaniasis in Brazil investigated through a cohort study: A challenging opportunity?

BACKGROUND: Visceral Leishmaniasis (VL) is the most severe form of leishmaniasis because it can lead to death. In the Americas, 96% of cases are in Brazil, and despite efforts, the fatality rate has increased in the past years. We analyzed deaths associated to VL in Brazil and investigated the factors that could influence on the timeliness of fatal outcome with emphasis on time (tStoD). METHODOLOGY: The registered deaths by VL were sourced from the Brazilian National Notification System from 2007-2014. Through a retrospective cohort study, univariate and multivariable Cox proportional hazards model analysis were performed and investigated the factors that could influence the time (tStoD). These factors were analyzed through survival models. RESULTS: Out of the 1,589 reported deaths, the median for onset of the symptoms and the case notification date (tStoN) is 25 days (10-61), and for date of case notification and death (tNotD) is 9 days (4-17). The time (tStoN) to event investigation for HIV non-infected individuals was 1.4 (1.16-1.68) greater than the HIV positive group. At the same time peri-urban and urban area were 0.83 (0.47-1.44) and 1.33 (1.16-1.52), respectively. The explorations revealed apparent differences between the time to event investigation (both for tStoN and tNotD) and the age at the onset of the symptoms. According to the tStoN the rate of notification is 1.73 times greater in patients under 5 years old at the onset of the clinical symptoms compared to older patients. CONCLUSION: VL patients under 5 years old were diagnosed earlier and had shorter survival. It could mean that in younger population, although properly diagnosed, the fatality pattern might be related to the severity of the disease. Main host characteristics were evaluated, and age and co-infections seem to have an impact in the disease progression.